В 1999 г. Фонд перерегистрирован как научно-общественная организация содействия изучению и пропаганде научного наследия Н. Д. Кондратьева, сохранив в официальном бланке организации ее прежнее название и логотип. Ее президент - академик РАН Л. И. Абалкин, вице-президенты - академик РАЕН Яковец Ю. В., член-корр. РАН Яновский Р. Г., академик РАЕН Дж. Паллавичини (Италия), член-корр. РАН - Гринберг Р. С., директор - член-корр. РАЕН Бондаренко В. М. В Совет Международного фонда Н. Д. Кондратьева вошли известные российские и зарубежные ученые.
Международный Фонд Н. Д. Кондратьева аккредитован при Отделении общественных наук Российской академии наук.
Основные направления деятельности Фонда:
- проведение Международных Кондратьевских конференций, симпозиумов, Кондратьевских чтений;
- выполнение междисциплинарных исследований по заказам государственных органов, грантам РФФИ и РГНФ и инициативных исследований по собственным планам;
- проведение совместно с Российской академией естественных наук международных конкурсов на соискание золотой, серебряной и бронзовой медалей Н.Д. Кондратьева за вклад в развитие общественных наук и памятной медали Н.Д. Кондратьева молодым ученым;
- издание монографий, материалов конференций, Кондратьевских чтений.
